Η έκθεση του Μουσείου Παλαιόπολης αποσκοπεί στο να πληροφορήσει τον επισκέπτη για τη χρήση του κτηρίου και την ιστορία του κτήματος από την αρχαιότητα ως τον 20ο αιώνα, αποκαλύπτοντας σημαντικές πτυχές της ζωής στην αρχαία Κέρκυρα και την ιστορική εξέλιξη της αρχαίας πόλης. Τα αντικείμενα που εκτίθενται, καλύπτουν την περίοδο κατασκευής της έπαυλης, όπου στεγάζεται το μουσείο, αλλά παράλληλα και όλους τους αιώνες ζωής της αρχαίας πόλης της Κέρκυρας (τέλη 8ου αι. π.Χ. ως το 500 μ.Χ.).
Η έκθεση είναι οργανωμένη κατά θεματικές ενότητες που ενέχουν και χρονολογική διαδοχή. Οι ενότητες αφορούν στην ιστορία της έπαυλης και του κτήματος, στους κυρίαρχους ρυθμούς του 19ου αι., οπότε και κτίστηκε η έπαυλη, στην αντίληψη της εποχής για την αρχαιότητα, στην ιστορική διαδρομή του νησιού και της πόλης αλλά και στη συνέχεια της ζωής στο χώρο της Παλαιόπολης. Αφορούν, τέλος, σε σημαντικούς τομείς της ζωής και της δραστηριότητας των αρχαίων Κερκυραίων αλλά και στην προσπάθεια της αρχαιολογικής έρευνας να ανακαλύψει, να ανασυνθέσει και να κάνει κτήμα όλων το παρελθόν.
